1緒論1
1.1微生物在自然界的地位1
1.1.1微生物的分類1
1.1.2微生物命名2
1.1.3微生物與動植物和人類的關系2
1.2微生物的特點3
1.2.1個體極小，結構簡單3
1.2.2容易變異、種類繁多3
1.2.3分布廣泛、代謝靈活4
1.2.4繁殖迅速、作用甚大4
1.3環境微生物的內容和任務4
1.3.1環境微生物的內容4
1.3.2環境微生物的任務6
1.4環境微生物的發展6
本章小結7
復習思考題7

2環境中微生物的主要類群8
2.1原核微生物8
2.1.1細菌8
2.1.2放線菌17
2.1.3其他原核微生物19
2.2真核微生物20
2.2.1真菌21
2.2.2微型藻類25
2.2.3原生動物34
2.2.4微型后生動物42
2.3非細胞型微生物——病毒45
2.3.1病毒的主要特征45
2.3.2病毒的形態與結構45
2.3.3病毒的繁殖46
2.3.4污水處理過程中對病毒的去除效果47
本章小結47
復習思考題48

3微生物生理50
3.1微生物的營養50
3.1.1微生物的化學組成50
3.1.2微生物的營養需求51
3.1.3微生物的營養類型53
3.1.4微生物的培養基55
3.2微生物的生長57
3.2.1微生物生長的測量57
3.2.2微生物群體生長規律58
3.2.3理化因子對微生物生長的影響60
3.2.4消毒與滅菌61
3.3微生物的代謝與遺傳變異64
3.3.1微生物的代謝64
3.3.2微生物的遺傳變異71
3.3.3菌種的衰退、復壯與保藏73
本章小結76
復習思考題77

4微生物生態79
4.1微生物在環境中的分布79
4.1.1土壤中的微生物79
4.1.2水體中的微生物80
4.1.3空氣中的微生物81
4.2微生物間的相互關系82
4.2.1共生關系82
4.2.2互生關系83
4.2.3寄生關系83
4.2.4拮抗關系83
4.3微生物在自然界物質循環中的作用84
4.3.1碳元素循環84
4.3.2氮元素循環85
4.3.3硫元素循環88
4.3.4磷元素循環90
本章小結91
復習思考題92

5微生物對環境的污染與危害93
5.1水體富營養化93
5.1.1富營養化的形成及影響因素94
5.1.2引起富營養化的優勢藻類95
5.1.3富營養化的危害95
5.1.4富營養化的防治96
5.2微生物代謝物與環境污染96
5.2.1微生物毒素與食品污染96
5.2.2氣味代謝物98
5.2.3酸性礦水99
5.2.4汞的生物甲基化99
5.2.5微生物引起的硝酸鹽還原對人體的影響100
本章小結100
復習思考題101

6微生物對污染物的降解與轉化102
6.1有機污染物的生物降解102
6.1.1微生物降解與轉化污染物的巨大潛力102
6.1.2有機污染物生物降解性的測定方法104
6.2微生物降解污染物的途徑107
6.2.1生物組分的大分子有機物的降解107
6.2.2石油的微生物降解109
6.2.3人工合成有機物的微生物降解111
本章小結114
復習思考題114

7微生物在環境污染治理中的作用116
7.1污水的生物處理類型116
7.1.1活性污泥法118
7.1.2生物膜法123
7.1.3穩定塘法126
7.1.4廢水的厭氧處理128
7.1.5利用光合細菌處理高濃度有機廢水131
7.2微污染水源水預處理的微生物應用132
7.2.1微污染水源水污染源、污染物及預處理的目的132
7.2.2微污染水源水微生物預處理132
7.2.3微污染水源水凈化對策133
7.3固體廢物的微生物處理133
7.3.1堆肥133
7.3.2衛生填埋136
7.3.3固體廢物的來源和危害137
本章小結137
復習思考題138

8水的衛生細菌學檢驗139
8.1水中的病原菌139
8.1.1痢疾桿菌139
8.1.2傷寒桿菌140
8.1.3霍亂弧菌140
8.2大腸菌群作為指標的意義及生活飲用水的標準141
8.2.1大腸菌群作為指標的意義141
8.2.2大腸菌群的生化特征比較141
8.2.3生活飲用水細菌標準142
8.3水的細菌檢驗142
8.3.1水中菌落總數的測定142
8.3.2大腸菌群的測定143
8.4水中微生物控制144
8.4.1含氯氧化劑的消毒144
8.4.2微電解消毒145
8.4.3紫外線消毒145
8.4.4臭氧消毒146
本章小結146
復習思考題146

9環境微生物新技術147
9.1生物脫氮和生物除磷147
9.1.1廢水的生物脫氮技術147
9.1.2廢水的生物除磷技術148
9.2固定化酶和固定化微生物技術150
9.2.1固定化酶和固定化微生物的固定化方法150
9.2.2固定化酶和固定化微生物在環境工程中的應用151
9.3生物傳感器152
9.4生物修復技術153
9.4.1生物修復的基本原理和特點153
9.4.2污染環境生物修復技術的應用154
9.5微生物技術與廢物綜合利用156
9.5.1利用廢物生產單細胞蛋白156
9.5.2利用廢物生產生物能源物質156
9.5.3固體廢物的處理利用157
9.6微生物技術與農、牧、漁業發展158
9.6.1微生物技術與漁、牧業生產158
9.6.2微生物技術與農業生產159
9.7微生物與綠色環保產品159
9.7.1微生物肥料160
9.7.2生物農藥160
9.7.3可生物降解的塑料161
9.7.4微生物絮凝劑161
9.7.5丙烯酰胺162
本章小結162
復習思考題163

10環境微生物實訓164
實訓一光學顯微鏡的使用及微生物個體形態的觀察164
實訓二細菌的革蘭染色167
實訓三培養基的制備及玻璃器皿的包扎滅菌169
實訓四微生物的純種分離173
實訓五環境中主要微生物菌落菌體形態的識別及大小測定技術176
實訓六藍細菌及藻類的形態觀察178
實訓七微型動物的形態觀察179
實訓八微生物顯微直接計數法180
實訓九空氣中微生物的檢測185
實訓十水中細菌菌落總數(CFU)的測定186
實訓十一水中大腸菌群數的檢測——多管發酵法190
實訓十二水中糞大腸菌群數的檢測——多管發酵法196
實訓十三大腸菌群數的檢測——濾膜法197
實訓十四微生物對有機物降解及轉化能力的定性分析199
實訓十五活性污泥和生物膜生物相的觀察203
實訓十六活性污泥脫氫酶活性的測定204
實訓十七含酚污水降解菌的分離純化與篩選206

附錄208
附錄一教學用培養基的配制208
附錄二染色液及試劑的配制211

參考文獻212