卷上 經絡臟腑 元氣存亡論 軀殼經絡臟腑論 表里上下論 陰陽升降論 治病必分經絡臟腑論 治病不必分經絡臟腑論 腎藏精論 一臟一腑先絕論 君火相火論 脈 診脈決死生論 脈癥輕重論 脈癥與病相反論 病 中風論 臌膈論 寒熱虛實真假論 內傷外感論 病情傳變論 病同人異論 病癥不同論 病同因別論 亡陰亡陽論 病有不愈不死雖愈必死論 卒死論 病有鬼神論 腎虛非陰癥論 吐血不死咳嗽必死論 胎產論 病有不必服藥論 方藥 方藥離合論 古方加減論 方劑古今論 單方論 禁方論 古今方劑大小論 藥誤不即死論 藥石性同用異論 劫劑論 制藥論 人參論 用藥如用兵論 執方治病論 湯藥不足盡病論 本草古今論 藥性變遷論 藥性專長論 煎藥法論 服藥法論 醫**藥論 乩方論 熱藥誤人*烈論 薄貼論 貌似古方欺人論 卷下 治法 司天運氣論 醫道通治道論 五方異治論 病隨國運論 針灸失傳論 水病針法論 出奇制病論 治病緩急論 治病分合論 發汗不用燥藥論 病不可輕汗論 傷風難治論 攻補寒熱同用論 臨病人問所便論 治病不必顧忌論 病深非淺藥能治論 愈病有日期論 治人必考其驗否論 防微論 知病必先知癥論 補藥可通融論 輕藥愈病論 腹內癰論 圍藥論 書論附科 《難經》論 《傷寒論》論 《金匱》論 《脈經》論 《千金方》《外臺》論 《活人書》論 《太素脈》論 婦科論 痘科論附：種痘說 幼科論 瘍科論 祝由科論 獸醫論 古今 四大家論 醫家論 醫學淵源論 考試醫學論 醫非人人可學論 名醫不可為論 邪說陷溺論 涉獵醫書誤人論 病家論 醫者誤人無罪論