緒論1**章　雞胚培養法 11**節　概況 11第二節　接種技術 11**節　概況 16第二節　動物接種16第三節　樣本的收集與處理 17**節　概況 20第二節　單層細胞培養20第三節　類器官培養 23**節　概況 27第二節　材料 27第三節　空斑滴定試驗28第四節　空斑減少中和試驗 28緒論1 **部分　病毒制備實驗技術方法**章　雞胚培養法 11**節　概況 11第二節　接種技術 11 第二章　動物接種法16**節　概況 16第二節　動物接種16第三節　樣本的收集與處理 17 第三章　組織培養法20**節　概況 20第二節　單層細胞培養20第三節　類器官培養 23 第四章　空斑及空斑減少中和試驗 27**節　概況 27第二節　材料 27第三節　空斑滴定試驗28第四節　空斑減少中和試驗 28 第五章　紅細胞凝集及凝集抑制試驗 30**節　概況 30第二節　紅細胞懸液制備30第三節　紅細胞凝集試驗33第四節　紅細胞凝集抑制試驗36第五節　紅細胞凝集抑制試驗抗體檢測39 第二部分　新藥發現與藥理學評價抗病毒藥物研發原理：快速發現技術與應用實踐 X第六章　流感病毒神經氨酸酶抑制活性評價47第七章　流感病毒內切酶抑制活性評價 50第八章　流感病毒血凝素抑制活性評價 53第九章　宿主關鍵蛋白 CLK1抑制活性評價56第十章　新型冠狀病毒 3CLpro抑制活性評價59第十一章　病毒誘導的細胞病變效應抑制活性評價61第十二章　流感病毒感染小鼠模型及藥效評價65第十三章　RT-PCR檢測技術68第十四章　炎癥因子檢測72 第三部分　虛擬篩選與網絡計算方法第十五章　虛擬篩選的計算資源介紹 77 **節　引言 77第二節　化合物庫資源78第三節　靶標庫資源 90第四節　虛擬篩選在線工具 96 第十六章　基于受體結構的虛擬篩選 103 **節　引言 103 第二節　分子對接103第三節　分子動力學模擬107第四節　全新藥物設計 110 第十七章　基于配體結構的虛擬篩選 114**節　引言 114第二節　2D/3D相似度搜索 114第三節　藥效團搜索 118第四節　機器學習與深度學習120 第十八章　基于網絡方法的虛擬篩選 128**節　引言 128第二節　網絡近鄰法 129第三節　其他網絡方法129 第十九章　網絡藥理學的技術方法 132 **節　引言 132 第二節　網絡藥理學相關理論132第三節　網絡藥理學常見數據庫、軟件及分析方法133第四節　網絡藥理學研究實踐流程 139 第四部分　靶向病毒蛋白的藥物發現第二十章　流感病毒神經氨酸酶（NA）抑制劑高通量篩選模型的建立與應用145**節　引言 145第二節　流感病毒 NA抑制劑篩選模型的建立 146第三節　流感病毒 NA抑制劑的高通量篩選154第二十一章　流感病毒 RNA聚合酶的內切酶抑制劑篩選模型的建立與新藥　　　　　　發現 158**節　引言 158第二節　流感病毒 RNA聚合酶的內切酶抑制劑高通量篩選模型的建立158第三節　PA抑制劑的理性篩選與新藥發現163第四節　討論與結論 167 第二十二章　細皺香薷中抗流感病毒活性成分的提取分離與活性評價169**節　引言 169第二節　細皺香薷中抗流感病毒活性成分的提取分離與結構鑒定 169第三節　抗流感病毒有效成分的評價172第四節　討論與結論 175 第二十三章　蘇木中抗流感病毒活性成分的提取分離與活性評價177**節　引言 177第二節　蘇木中抗流感病毒活性成分的提取分離與結構鑒定177第三節　抗病毒有效成分的評價180第四節　討論與結論 182 第二十四章　猴耳環等中藥中抗流感病毒活性成分研究 184**節　引言 184第二節　猴耳環中抗流感病毒活性成分研究184第三節　虎杖中抗流感病毒活性成分研究 187第四節　買麻藤中抗流感病毒活性成分研究189第五節　甘草中抗流感病毒活性成分研究 191 第二十五章　黃酮類化合物作為流感病毒 NA抑制劑的構效關系分析 195**節　引言 195第二節　黃酮類化合物抗流感病毒活性評價195第三節　黃酮類化合物抑制 NA的構效關系分析201 目　　錄 第四節　討論與結論 202 第二十六章　臨床常用中成藥體外抗流感病毒作用再評價 206 **節　引言 206 XII第二節　臨床常用中成藥流感病毒 NA抑制活性評價 206第三節　細胞水平抗流感病毒活性評價209第四節　討論與結論 211 第五部分　靶向宿主蛋白的藥物發現第二十七章　宿主蛋白 CLK1抑制劑篩選模型的建立與新藥發現215 **節　引言 215第二節　宿主蛋白 CLK1抑制劑篩選模型的建立 216第三節　CLK1抑制劑的抗流感病毒活性221 第二十八章　圍涎素體內抗流感病毒藥效及其作用機制研究 225 **節　引言 225第二節　圍涎素體內抗流感病毒藥效225第三節　圍涎素抗流感病毒機制研究230 第六部分　基于虛擬篩選與網絡計算的藥物發現第二十九章　基于機器學習的流感病毒 NA抑制劑預測模型的建立與新藥發現241**節　引言 241 抗病毒藥物研發原理：快速發現技術與應用實踐 第二節　NA抑制劑預測模型的建立241第三節　NA抑制劑的預測與活性 250第四節　討論與結論 252 第三十章　基于機器學習的新型冠狀病毒 3CLpro抑制劑的發現與體外抗病毒　　　　　活性驗證254**節　引言 254第二節　新型冠狀病毒 3CLpro抑制劑預測模型的建立254第三節　3CLpro抑制劑的預測與實驗驗證260第四節　討論與結論 265 第三十一章　基于網絡鄰近法和宿主 -病毒相互作用組的抗流感病毒藥物發現267**節　引言 267第二節　基于網絡鄰近法和宿主 -病毒相互作用組的抗流感病毒藥物發現267第三節　苗頭藥物體外抗流感病毒活性評價270第四節　苗頭藥物抗流感病毒的初步機制研究276 第五節　討論與結論 280 第三十二章　基于網絡鄰近法和宿主 -病毒相互作用組的抗新型冠狀病毒藥物　　　　　　發現 282**節　引言 282第二節　基于網絡鄰近法的抗新型冠狀病毒藥物發現283第三節　抗新型冠狀病毒活性驗證與機制探討291第四節　討論與結論 293 第三十三章　沙美特羅體內外抗甲型流感病毒的藥效確證與機制研究296**節　引言 296第二節　沙美特羅體內外抗甲型流感病毒的藥效作用296第三節　沙美特羅抗流感病毒作用機制300第四節　討論與結論 306 第三十四章　復方一枝蒿抗流感有效成分的預測與網絡機制研究310**節　引言 310第二節　化合物 -靶標相互作用預測模型的建立和 CYZH有效成分預測310第三節　復方一枝蒿抗流感有效成分的預測與驗證318第四節　討論與結論 323 第三十五章　小柴胡湯抗人冠狀病毒感染的物質基礎與網絡機制研究326**節　引言 326第二節　小柴胡湯抗人冠狀病毒感染的有效成分發現328第三節　小柴胡湯抗人冠狀病毒感染的網絡機制研究341第四節　討論與結論 345 附錄349 致謝372 目　　錄