**篇 緒論
**章 柑橘與柑橘潰瘍病 002
**節 柑橘概述 002
一、柑橘 002
二、柑橘的用途 002
第二節 柑橘產業發展現狀與面臨的問題 003
一、柑橘產業發展現狀 003
二、柑橘產業面臨的問題 004
第三節 柑橘潰瘍病及其危害 004
一、柑橘潰瘍病 004
二、柑橘潰瘍病的危害 004
第四節 柑橘潰瘍病菌的侵染與傳播 005
一、柑橘潰瘍病菌的侵染 005
二、柑橘潰瘍病的傳播 005 第二章 柑橘潰瘍病的防治 007
**節 綜合防治策略 007
一、控制傳染源 007
二、切斷遠距離傳播途徑 008
三、培育抗病新品種 008
第二節 抗、感病基因資源及應用 009
一、非柑橘源抗病相關基因及應用 009
二、柑橘源抗病相關基因及應用 010 第三章 柑橘抗病分子育種的技術體系和研究方法 012
**節 基因轉化體系 012
一、表達載體 012
二、柑橘遺傳轉化和鑒定 012
三、柑橘瞬時轉化 013
四、病毒介導的基因沉默 014
第二節 柑橘潰瘍病抗性評價體系 015
一、針刺法 015
二、注射法 015
三、柑橘潰瘍病菌生長曲線 015
第三節 分子生物學方法 016
一、蛋白質與蛋白質互作 016
二、蛋白質與DNA 互作 016
第四節 生物信息學和統計學方法 017
一、主要的生物信息學方法 017
二、統計學方法 018
第二篇 轉錄調控因子
第四章 CsAP2-09 在柑橘潰瘍病中的功能 020
**節 AP2/ERF 轉錄因子的研究背景 020
一、AP2/ERF 轉錄因子的結構與分類 020
二、AP2/ERF 轉錄因子的功能 021
第二節 柑橘AP2 家族分析 021
一、柑橘AP2 家族的鑒定 021
二、柑橘AP2 家族保守結構域和系統發育分析 022
三、柑橘AP2 家族受潰瘍病誘導的表達模式 022
第三節 CsAP2-09 的生物信息學和表達分析 024
一、CsAP2-09 的生物信息學特征 024
二、CsAP2-09 受外源激素誘導表達 026
三、CsAP2-09 的亞細胞定位和轉錄激活活性 026
第四節 CsAP2-09 正調控柑橘潰瘍病抗性 027
第五節 CsAP2-09 調控柑橘潰瘍病抗性的分子機制 029
一、CsAP2-09 過表達植株的轉錄組分析 029
二、CsAP2-09 調控水楊酸和茉莉酸的合成 031
三、CsAP2-09 調控過氧化物酶和超氧化物歧化酶活性 031
四、CsAP2-09 調控柑橘活性氧水平 032
五、CsAP2-09 調控柑橘潰瘍病菌侵染的超敏反應 034
六、CsAP2-09 調控植物細胞木質素化 034
七、CsAP2-09 與多個抗病相關蛋白互作 035
第六節 本章小結 036 第五章 CsBZIP40 在柑橘潰瘍病中的功能 038
**節 BZIP 轉錄因子的研究背景 038
第二節 柑橘BZIP 家族分析 039
一、柑橘BZIP 家族 039
二、柑橘BZIP 家族染色體定位和基因復制 041
三、柑橘BZIP 家族的信息學特征 041
第三節 CsBZIP40 的表達分析 043
一、CsBZIP40 的亞細胞定位 043
二、CsBZIP40 受潰瘍病的誘導表達模式 044
三、CsBZIP40 受外源激素的誘導表達模式 044
第四節 CsBZIP40 正調控柑橘潰瘍病抗性 045
一、CsBZIP40 過表達增強柑橘潰瘍病抗性 045
二、CsBZIP40 的干擾表達可增強柑橘潰瘍病易感性 045
第五節 CsBZIP40 調控柑橘潰瘍病抗性的機制 047
一、CsBZIP40 與CsNPR1 互作并調控水楊酸合成 047
二、CsBZIP40 調控水楊酸響應基因 047
三、CsBZIP40 調控活性氧平衡 049
第六節 本章小結 050 第六章 CsWRKY43 在柑橘潰瘍病中的功能 052
**節 WRKY 轉錄因子的研究背景 052
一、WRKY 轉錄因子的結構 052
二、WRKY 轉錄因子的功能 052
三、WRKY 轉錄因子的調控機制 053
第二節 CsWRKY43 的生物信息學特征 053
第三節 CsWRKY43 的表達特征 054
一、CsWRKY43 的亞細胞定位 054
二、CsWRKY43 受潰瘍病的誘導表達模式 055
第四節 CsWRKY43 負調控柑橘潰瘍病抗性 056
第五節 CsWRKY43 負調控柑橘潰瘍病抗性的機制 057
一、CsWRKY43 調控過氧化物酶酶活性 057
二、CsWRKY43 靶向并激活CsPRX53 057
第六節 本章小結 059 第七章 CsWRKY61 在柑橘潰瘍病中的功能 061
**節 CsWRKY61 的生物信息學特征 061
第二節 CsWRKY61 的表達特征 062
一、CsWRKY61 的亞細胞定位 062
二、CsWRKY61 受潰瘍病的誘導表達模式 062
第三節 CsWRKY61 正調控柑橘潰瘍病抗性 063
第四節 CsWRKY61 調控柑橘潰瘍病抗性的機制 064
第五節 本章小結 065 第八章 CitMYB20 在柑橘潰瘍病中的功能 066
**節 MYB 轉錄因子的研究背景 066
第二節 CitMYB20 的表達特征 066
一、CitMYB20 受潰瘍病的誘導表達模式 066
二、CitMYB20 受激素的誘導表達模式 067
第三節 CitMYB20 正調控柑橘潰瘍病抗性 068
一、CitMYB20 轉基因植株鑒定 068
二、CitMYB20 轉基因植株抗性評價 068
第四節 本章小結 070 第九章 CiNPR4 在柑橘潰瘍病中的功能 072
**節 病程相關基因非表達子的研究背景 072
第二節 CiNPR4 正調控柑橘潰瘍病抗性 072
第三節 CiNPR4 正調控柑橘潰瘍病抗性的機制 074
一、CiNPR4 調控水楊酸和茉莉酸合成 074
二、CiNPR4 調控水楊酸和茉莉酸響應基因 074
三、CiNPR4 與CsTGA2 互作 075
第四節 本章小結 076
第三篇 植物免疫受體
第十章 CsWAKL08 在柑橘抗潰瘍病中的功能 079
**節 細胞壁關聯的類受體激酶的研究背景 079
一、細胞壁關聯的類受體激酶的發現 079
二、細胞壁關聯的類受體激酶的結構和分類 080
三、細胞壁關聯的類受體激酶的功能和機制 080
第二節 柑橘WAKL 家族分析 081
一、柑橘WAKL 家族的鑒定 081
二、柑橘WAKL 家族的系統發育 082
三、柑橘WAKL 家族的結構域 083
第三節 柑橘WAKL 家族受潰瘍病的誘導表達模式 084
第四節 CsWAKL08 的信息學和表達特征 085
一、CsWAKL08 的信息學特征 085
二、CsWAKL08 受水楊酸和茉莉酸誘導表達模式 086
三、CsWAKL08 定位于質膜 087
第五節 CsWAKL08 正調控柑橘潰瘍病抗性 087
一、CsWAKL08 過表達增強柑橘潰瘍病抗性 087
二、CsWAKL08 干擾增強柑橘潰瘍病易感性 089
第六節 CsWAKL08 正調控柑橘潰瘍病抗性的機制 090
一、CsWAKL08 調控活性氧平衡 090
二、CsWAKL08 調控茉莉酸的生物合成 091
三、CsWAKL08 調控茉莉酸響應基因 091
第七節 本章小結 092 第十一章 CsLYK6 在柑橘潰瘍病中的功能 093
**節 溶解素基序類受體激酶的研究背景 093
一、溶解素基序類受體激酶的發現 093
二、溶解素基序類受體激酶的功能和機制 093
第二節 柑橘LYK 家族分析 095
一、柑橘LYK 家族的鑒定 095
二、柑橘LYK 家族的系統發育 095
第三節 CsLYK6 的生物信息學特征 096
第四節 CsLYK6 的表達特征 097
一、CsLYK6 受柑橘潰瘍病的誘導表達模式 097
二、CsLYK6 的亞細胞定位 097
第五節 CsLYK6 正調控柑橘潰瘍病抗性 098
第六節 CsLYK6 正調控柑橘潰瘍病抗性的機制 099
一、CsLYK6 調控過氧化氫合成 099
二、CsLYK6 調控CsRBOH5 的磷酸化和轉錄 100
三、CsLYK6-CsCPK13-CsMAPK6 模塊調控CsRBOH5 的磷酸化 100
四、CsLYK6-CsMAPK6-CsWRKY33 模塊調控CsRBOH5 的轉錄 101
第七節 本章小結 103 第十二章 CsNBS-LRR 在柑橘潰瘍病中的功能 105
**節 NBS-LRR 的研究背景 105
第二節 柑橘NBS-LRR 的生物信息學特征 106
第三節 柑橘CsNBS-LRR 的表達特征 106
第四節 柑橘CsNBS-LRR 正調控柑橘潰瘍病抗性 107
第五節 柑橘CsNBS-LRR 正調控柑橘潰瘍病抗性的機制 108
一、CsNBS-LRR 調控水楊酸和茉莉酸合成 108
二、CsNBS-LRR 調控水楊酸響應基因 108
第六節 本章小結 109
第四篇 植物ROS 平衡調控酶系統
第十三章 CsPrx25 在柑橘潰瘍病中的功能 112
**節 CⅢ過氧化物酶的研究背景 112
第二節 柑橘CⅢ Prx 家族分析 113
一、柑橘CⅢ Prx 家族的鑒定 113
二、柑橘CⅢ Prx 家族的系統發育 115
三、柑橘CⅢ Prx 家族的染色體定位 116
第三節 柑橘CⅢ Prx 家族的生物信息學特征 117
第四節 CsPrx25 的表達特征 118
一、CsPrx25 定位于質外體 118
二、CsPrx25 受潰瘍病的誘導表達模式 118
第五節 CsPrx25 正調控柑橘潰瘍病抗性 119
第六節 CsPrx25 正調控柑橘潰瘍病抗性的機制 120
一、CsPrx25 調控酶促抗氧化系統 120
二、CsPrx25 調控活性氧平衡 120
三、CsPrx25 調控木質化 122
第七節 本章小結 122 第十四章 CsGSTU18 和CsGSTF1 在柑橘潰瘍病中的功能 124
**節 谷胱甘肽-S - 轉移酶的研究背景 124
第二節 柑橘GST 家族分析 125
一、柑橘GST 家族的鑒定 125
二、柑橘GST 家族的系統發育 128
三、柑橘GST 家族的染色體定位 128
四、柑橘GST 家族的基因結構和保守基序 128
第三節 CsGSTU18 和CsGSTF1 的表達特征 130
一、CsGSTU18 和CsGSTF1 受柑橘潰瘍病誘導表達模式 130
二、CsGSTU18 和CsGSTF1 受激素誘導表達模式 130
三、CsGSTU18 和CsGSTF1 的亞細胞定位 131
第四節 CsGSTU18 和CsGSTF1 在柑橘潰瘍病中的功能 132
一、CsGSTU18 和CsGSTF1 瞬時轉化降低ROS 水平 132
二、CsGSTU18 和CsGSTF1 的沉默增強潰瘍病抗性 132
第五節 CsGSTU18 和CsGSTF1 調控柑橘潰瘍病抗性的機制 133
第六節 本章小結 134
第五篇 植物細胞壁代謝相關酶
第十五章 CsXTH04 在柑橘潰瘍病中的功能 136
**節 木葡聚糖內轉葡萄糖基/ 水解酶的研究背景 136
第二節 柑橘XTH 家族分析 136
一、柑橘XTH 家族的鑒定 136
二、柑橘XTH 家族的系統發育 138
三、柑橘XTH 家族的染色體定位與基因復制 138
第三節 柑橘XTH 家族鑒定的表達特征 141
第四節 CsXTH04 的表達特征 142
第五節 CsXTH04 負調控柑橘潰瘍病抗性 142
一、CsXTH04 過表達增強柑橘潰瘍病易感性 142
二、CsXTH04 干擾增強柑橘潰瘍病抗性 143
第六節 本章小結 144 第十六章 CsPAE2 在柑橘潰瘍病中的功能 146
**節 果膠乙酰酯酶的研究背景 146
第二節 柑橘PAE 家族分析 147
一、柑橘PAE 家族的鑒定 147
二、柑橘PAE 家族的系統發育 148
三、柑橘PAE 家族的保守結構域和二級結構 148
四、柑橘PAE 家族的染色體定位和基因結構 148
第三節 CsPAE2 受柑橘潰瘍病誘導表達模式 150
第四節 CsPAE2 負調控柑橘潰瘍病抗性 151
一、CsPAE2 過表達增強潰瘍病易感性 151
二、CsPAE2 沉默增強柑橘潰瘍病抗性 152
第五節 本章小結 152 第十七章 CsPGIP 在柑橘潰瘍病中的功能 154
**節 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白的研究背景 154
第二節 柑橘PGIP 的生物信息學特征 155
第三節 CsPGIP 的表達特征 156
一、CsPGIP 的亞細胞定位 156
二、CsPGIP 受柑橘潰瘍病的誘導表達模式 156
第四節 CsPGIP 正調控柑橘潰瘍病抗性 158
一、CsPGIP 過表達轉基因植株的鑒定 158
二、CsPGIP 過表達轉基因植株的表型 158
三、CsPGIP 過表達轉基因植株的抗性評價 158
第五節 本章小結 160
附錄 162 參考文獻 178 后記 186