目錄
上篇 總論 1
**章 緒論 3
**節(jié) 葉綠體及其基因組 3
第二節(jié) 葉綠體基因組圖譜及應(yīng)用 7
第二章 葉綠體基因組圖譜的構(gòu)建原理與方法 16
**節(jié) 標(biāo)本采集及DNA提取 16
第二節(jié) 第二代測序文庫的構(gòu)建與測序 18
第三節(jié) 葉綠體基因組的組裝 22
第四節(jié) 葉綠體基因組注釋 24
第五節(jié) 重復(fù)序列的類型及其發(fā)現(xiàn) 27
第六節(jié) 宏DNA條形碼 29
第三章 葉綠體基因組常用生物信息分析軟件 33
**節(jié) 葉綠體基因組組裝軟件 33
第二節(jié) 葉綠體基因組注釋軟件 46
第三節(jié) 葉綠體基因組分析軟件 52
下篇 各論 59
1 川貝母 61
2 大麥 72
3 北馬兜鈴 78
4 蒜 84
5 丹參 92
6 巴戟天 98
7 白及 104
8 白木通 110
9 艾 116
10 白頭翁 124
11 吊石苣苔 130
12 杭白芷 136
13 白茅 142
14 石斛 148
15 紅花 155
16 地黃 161
17 杜仲 168
18 川赤芍 174
19 赤豆 182
20 土沉香 189
21 連翹 196
22 花椒 202
23 卷丹 208
24 細(xì)辛 220
25 金毛狗 228
26 垂盆草 234
27 金蕎麥 239
28 金錢松 245
29 黃花蒿 251
30 茶 259
31 北烏頭 266
32 華中五味子 274
33 穿心蓮 280
34 厚樸 286
35 荔枝 298
36 茴香 304
37 獨(dú)蒜蘭 310
38 蓮 316
39 粗莖秦艽 323
40 海金沙 330
41 胡桃 335
42 黃連 342
43 黃芩 348
44 黃精 355
45 黃檗 363
46 構(gòu)樹 369
47 蓖麻 375
48 榧樹 382
49 辣椒 389
50 稻 397
51 鱧腸 404
52 柑橘 410
53 藁本 418
附錄 425