目錄**部分 癌癥的基本原理**章 癌癥基因組 1引言 1癌癥基因和突變 1癌基因的鑒定 2通過癌癥基因組分析檢測體細胞變異類型 12癌癥基因組分析中的信號通路導向模型 15癌癥基因組計劃網絡 20癌癥基因組全景圖 20癌癥基因組的綜合分析 21癌癥基因組與腫瘤的新分類 23癌癥基因組學與耐藥性 25癌癥基因組分析的展望 27致謝 28第二章 癌癥的標志性特征：癌癥醫學遵循的法則 37引言 37本質上的標志性能力 38兩個普遍的特性協助標志性特征的獲得 54構成腫瘤微環境的細胞類型 56癌癥標志性特征的靶向治療 65結論和對未來的展望 67致謝 68第三章 腫瘤分子檢測方法 78分子診斷在腫瘤研究中的應用 78臨床分子診斷實驗室：原則和法規 83分子診斷的樣本要求 84分子診斷的檢測過程 84技術 86第四章 致瘤病毒 104腫瘤病毒學原理 104乳頭狀瘤病毒 107多瘤病毒 110EB 病毒 112Kaposi 肉瘤皰疹病毒 115動物和人類反轉錄病毒 117肝炎病毒 120結論 124第五章 炎癥 132引言 132炎癥的分子基礎 133炎癥在細胞轉化中的作用 133炎癥在細胞存活中的作用 134炎癥在細胞增殖中的作用 135炎癥在細胞侵襲中的作用 135炎癥在血管生成中的作用 136炎癥在腫瘤轉移中的作用 137表觀遺傳學改變和炎癥 138炎癥在腫瘤診斷中的作用 138炎癥和轉化醫學 139結論 139第六章 抗腫瘤藥物——激酶抑制劑 146引言 146早期的成功：靶向已知激酶突變的癌癥 147直接靶向PI3K 通路 160激酶抑制劑的組合誘導反應和預防抵抗性 160對未來的思考：激酶抑制劑在癌癥醫學中的作用 161第七章 抗血管生成制劑 168引言 168血管生成過程 168血管生成抑制劑的藥物開發 170已批準的抗血管生成藥物在腫瘤治療中的臨床應用 174聯合治療 181抗血管生成療法的生物標志物 182抗血管生成治療的治療抵抗 183第二部分 各種癌癥的分子生物學第八章 頭頸部腫瘤的分子生物學 192引言 192頭頸部鱗狀細胞癌的分子機制 195癌癥基因組圖譜計劃 196癌癥干細胞 198第九章 肺癌的分子生物學 203引言 203肺癌的易感性：遺傳易感性和煙草中的致癌物 204癌前病變的分子變異 205肺癌中的遺傳和表觀遺傳變化 205原癌基因、生長因子通路和生長因子靶向治療 207肺癌的基因組分析技術 210表觀遺傳學/ 表觀基因組學 212抑癌基因和生長抑制 212細胞周期蛋白和細胞周期調控通路 213LKB1、AMPK 和mTOR 信號通路 214其他公認的抑癌基因 215肺癌中其他生物學異常 216miRNA 在肺癌診斷和治療中的作用 217肺癌miRNA 譜 218侵襲、轉移和血管生成 221癌癥干細胞假說 221肺癌臨床的分子工具 222第十章 食管癌和胃癌的分子生物學 236引言 236食管癌的分子生物學 236胃癌的分子生物學 240第十一章 胰腺癌的分子生物學 247引言 247常見的分子改變 248第十二章 肝癌的分子生物學 261引言 261肝癌的遺傳學改變 262肝癌的表觀遺傳學改變 263肝癌遺傳學改變的突變圖譜：新一代 264肝癌微環境 266肝細胞癌的分類和預后預測 267結論和展望 268第十三章 結直腸癌的分子生物學 273引言 273結直腸癌多階段模型 273癌癥風險增高的遺傳性綜合征強調了結直腸癌發生的早期事件和關鍵通路 276結直腸癌的發生和進展的整合模型 288結論 289第十四章 腎癌的分子生物學 298引言 298VHL 病 298遺傳性乳頭狀腎細胞癌1 型 301Xp11.2 易位腎細胞癌 301Birt-Hogg-Dubé 綜合征 302遺傳性平滑肌瘤病和腎細胞癌 303家族性腎癌：琥珀酸脫氫酶基因 306結節性硬化癥 306結論 307第十五章 膀胱癌的分子生物學 315引言 315非浸潤階段尿路上皮癌的關鍵分子改變 315浸潤性尿路上皮癌的關鍵分子改變 321外顯子組的測序信息 326表觀遺傳學改變 327來自表達譜的信息 327尿路上皮腫瘤起始細胞 328分子發病機制和腫瘤克隆 328多腫瘤亞組定義的分子表達譜 329致謝 331第十六章 前列腺癌的分子生物學 344引言 344前列腺癌的基因組全景概述 344雄激素受體生物學和治療 346疾病進展期間其他經常被改變的通路 348E26 轉化特異性基因融合與前列腺癌分子亞型 349前列腺癌生物學和治療的新興領域 351第十七章 婦科癌癥的分子生物學 360引言 360卵巢癌 360子宮內膜癌 368子宮頸、陰道和外陰癌 370第十八章 乳腺癌的分子生物學 376引言 376乳腺癌的遺傳學 376遺傳性乳腺癌 377乳腺癌的體細胞改變 381乳腺癌的轉錄譜 382乳腺癌的表觀遺傳學 386蛋白質/ 通路的改變 387雌激素受體途徑 387結論 391第十九章 內分泌腫瘤的分子生物學 396引言 396多發性內分泌腫瘤綜合征 396分子遺傳學在臨床醫學中的應用 404甲狀腺癌 404未來研究方向 407第二十章 肉瘤的分子生物學 413引言 413染色體易位相關的軟組織肉瘤 418與突變相關的簡單核型軟組織肉瘤 422復雜軟組織肉瘤類型 423軟骨腫瘤 427骨肉瘤 429未來的發展：新一代測序和功能篩選 430第二十一章 皮膚黑色素瘤的分子生物學 444引言 444RAS-RAF-MAPK 通路 445MAPK 通路和治療抵抗 450黑色素合成途徑 454黑色素瘤的分子遺傳學：展望未來 456第二十二章 中樞神經系統腫瘤的分子生物學 464膠質瘤 464腦膜瘤 470髓母細胞瘤 472室管膜瘤 474結論 475第二十三章 兒童癌癥的分子生物學 479引言 479抑癌基因 481視網膜母細胞瘤：范例 482琥珀酸脫氫酶缺陷的胃腸道間質瘤 483神經纖維瘤 483神經母細胞瘤 484尤因肉瘤家族腫瘤 485橫紋肌肉瘤 486兒童Li-Fraumeni 綜合征腫瘤相關的遺傳性綜合征 487惡性橫紋肌樣瘤 489DICER1 綜合征 489生殖細胞突變和兒童癌癥的預測性檢測 490分子治療 490第二十四章 淋巴瘤的分子生物學 498引言 498淋巴瘤的起源細胞 498淋巴瘤遺傳病變的普遍機制 501B 細胞非霍奇金淋巴瘤的分子發病機制 505T 細胞非霍奇金淋巴瘤的分子發病機制 517霍奇金淋巴瘤的分子發病機制 520第二十五章 急性白血病的分子生物學 538引言 538白血病干細胞 541急性白血病中的遺傳學事件 542以核心結合因子為靶標的染色體易位 543以維甲酸受體α 為靶標的染色體易位 544靶向HOX 家族成員的突變 545靶向MLL 基因的染色體易位 546C/EBPα 突變 547GATA-1 突變 548與小兒急性巨核細胞白血病相關的t（1；22）易位 548表觀修飾因子的突變 548導致c-MYC 基因過表達的染色體易位 550與T 細胞受體相關的染色體易位 550急性白血病中的點突變 550抑癌基因突變 552NOTCH 的激活突變 553改變NPM1 定位的突變 554急性淋巴性白血病淋巴發育基因的突變 554急性白血病的突變互補群 555結論 556第二十六章 慢性白血病的分子生物學 566引言 566慢性粒細胞白血病 566慢性淋巴細胞白血病 571第三部分 遺傳咨詢第二十七章 遺傳咨詢 583引言 583腫瘤遺傳咨詢的候選者 584腫瘤遺傳咨詢的不同階段 585腫瘤遺傳咨詢存在的問題 591近期進展和未來方向 594第二十八章 乳腺癌的遺傳檢測 600引言 600乳腺癌高風險人群鑒別 600基因檢測 600BRCA1 和BRCA2 601TP53 604Cowden 綜合征 606其他遺傳突變和乳腺癌 609中和低外顯率乳腺癌易感基因 610結論 611第二十九章 卵巢癌的遺傳檢測 619引言 619遺傳性乳腺癌和卵巢癌綜合征——BRCA1 和BRCA2 基因 620Lynch 綜合征 622新基因 625結論 626第三十章 結直腸癌的遺傳檢測（息肉綜合征） 633引言 633腺瘤性息肉病 634錯構瘤性息肉病 638結論 641第三十一章 結直腸癌的遺傳檢測（非息肉綜合征） 644引言 644臨床分類：Amsterdam 標準和Bethesda 指南 645腫瘤篩查 646基因檢測 647Lynch 綜合征的遺傳咨詢 647Lynch 綜合征的健康管理 648致謝 648第三十二章 子宮癌的遺傳檢測 651引言 651Lynch 綜合征 651磷酸酶和張力蛋白同源性錯構瘤綜合征 653遺傳性平滑肌瘤和腎細胞癌 653子宮癌和其他遺傳性腫瘤綜合征 654結論 655第三十三章 泌尿道癌的遺傳檢測 659引言 659腎細胞癌的遺傳易感性 660泌尿道上皮癌的遺傳易感性 664遺傳性檢測的指標 665遺傳性檢測和咨詢 666結論 667第三十四章 胰腺癌的遺傳檢測 670引言 670胰腺癌的致病基因 670增加胰腺癌風險的綜合征 673經驗風險咨詢和管理 674第三十五章 胃癌的遺傳檢測 679引言 679組織學的定義及描述 679病因 680