前言**章 棉花纖維基因資源與創(chuàng)新 **節(jié) 棉花起源與進(jìn)化 一、棉屬的系統(tǒng)分類 二、二倍體棉種的起源與進(jìn)化 三、四倍體棉種的起源與進(jìn)化 第二節(jié) 棉花纖維基因資源挖掘與創(chuàng)制 一、棉花纖維基因資源創(chuàng)制 二、棉花纖維基因資源挖掘與利用 第三節(jié) 棉花遺傳連鎖圖的構(gòu)建 一、遺傳群體的構(gòu)建 二、分子標(biāo)記的開發(fā) 三、高密度連鎖圖的構(gòu)建 參考文獻(xiàn)第二章 棉花基因組學(xué)研究 **節(jié) 植物基因組學(xué)研究進(jìn)展 一、高通量DNA測(cè)序技術(shù) 二、模式植物基因組研究進(jìn)展 三、重要農(nóng)作物基因組學(xué)研究進(jìn)展 第二節(jié) 棉花D基因組(雷蒙德氏棉)研究 一、測(cè)序、組裝與注釋 二、古六倍體化事件和全基因組復(fù)制 三、轉(zhuǎn)座子擴(kuò)增與簡(jiǎn)單序列重復(fù) 四、纖維發(fā)育、棉酚生物合成相關(guān)基因分析 第三節(jié) 棉花A基因組(亞洲棉)研究 一、測(cè)序、組裝與注釋 二、A基因組與D基因組比較分析 三、重要農(nóng)藝性狀相關(guān)功能基因分析 四、A基因組資源應(yīng)用前景 參考文獻(xiàn)第三章 棉花纖維轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究 **節(jié) 轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究技術(shù) 一、功能基因組學(xué)核心技術(shù) 二、基因芯片數(shù)據(jù)分析技術(shù)及相關(guān)資源 三、基因表達(dá)系列分析技術(shù) 四、轉(zhuǎn)錄組分析和RNA—Seq 五、棉花eDNA減法技術(shù) 第二節(jié) 乙烯與纖維發(fā)育 一、棉花中參與乙烯合成基因的研究 二、乙烯在棉花纖維伸長(zhǎng)過程中起重要作用 三、油菜素內(nèi)酯對(duì)纖維細(xì)胞發(fā)育的影響及與乙烯的相互作用 第三節(jié) 超長(zhǎng)鏈脂肪酸與纖維發(fā)育 一、超長(zhǎng)鏈脂肪酸的合成途徑及其調(diào)控機(jī)制研究 二、植物體內(nèi)超長(zhǎng)鏈脂肪酸功能研究 三、棉花纖維中超長(zhǎng)鏈脂肪酸功能研究 第四節(jié) 初生壁合成與纖維發(fā)育 一、植物細(xì)胞壁的結(jié)構(gòu)與核苷糖代謝 二、棉花纖維中初生壁合成的研究 第五節(jié) 次生壁加厚期轉(zhuǎn)錄組研究 一、海陸F2群體次生壁加厚期轉(zhuǎn)錄組研究 二、海陸B(tài)Cl群體次生壁加厚期轉(zhuǎn)錄組研究 三、次生壁加厚期轉(zhuǎn)錄組基因挖掘與分析 參考文獻(xiàn)第四章 棉花纖維蛋白質(zhì)組學(xué)研究 **節(jié) 棉花纖維蛋白質(zhì)組學(xué)研究新方法 一、棉花纖維總蛋白的酚提取法 二、棉花纖維總蛋白提取方法評(píng)價(jià) 三、棉花纖維蛋白質(zhì)組分析技術(shù)路線 第二節(jié) 長(zhǎng)纖維伸長(zhǎng)期差異顯示蛋白的鑒定與圖譜構(gòu)建 一、長(zhǎng)纖維伸長(zhǎng)期蛋白質(zhì)總量的動(dòng)態(tài)變化 二、長(zhǎng)纖維伸長(zhǎng)期蛋白質(zhì)組的動(dòng)態(tài)變化 三、長(zhǎng)纖維伸長(zhǎng)期差異表達(dá)蛋白的質(zhì)譜鑒定 四、長(zhǎng)纖維伸長(zhǎng)過程中的活躍生化途徑 第三節(jié) 短纖維起始期差異顯示蛋白的鑒定與圖譜構(gòu)建 一、短纖維起始期蛋白質(zhì)組的動(dòng)態(tài)變化 二、短纖維起始期差異表達(dá)蛋白的質(zhì)譜鑒定 三、短纖維起始期重要蛋白質(zhì)的動(dòng)態(tài)變化 四、短纖維起始期的差異表達(dá)蛋白調(diào)控網(wǎng)絡(luò) 第四節(jié) 棉花纖維細(xì)胞差異顯示磷酸化蛋白質(zhì)的質(zhì)譜鑒定 一、棉花纖維伸長(zhǎng)過程中差異顯示蛋白的磷酸化修飾程度 二、二維電泳凝膠中單個(gè)磷酸化蛋白質(zhì)的質(zhì)譜鑒定方法 三、磷酸化肽段的預(yù)測(cè)及其磷酸化位點(diǎn)的質(zhì)譜鑒定 四、伸長(zhǎng)期差異表達(dá)磷酸化蛋白質(zhì)的功能分析 第五節(jié) 蛋白質(zhì)組學(xué)分析所揭示的棉花纖維伸長(zhǎng)過程中活躍的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò) 一、碳水化合物代謝相關(guān)的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò) 二、蛋白質(zhì)代謝相關(guān)的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò) 三、細(xì)胞骨架和囊泡運(yùn)輸相關(guān)的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)圖 四、滲透壓調(diào)控相關(guān)的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò) 參考文獻(xiàn)第五章 棉花纖維基因克隆與功能驗(yàn)證 **節(jié) 棉花纖維發(fā)育重要基因的克隆與功能驗(yàn)證 一、轉(zhuǎn)錄因子對(duì)棉花纖維發(fā)育的調(diào)控 二、植物激素對(duì)棉花纖維發(fā)育的調(diào)控 三、功能基因?qū)γ藁ɡw維發(fā)育的調(diào)控 四、相關(guān)基因的克隆與功能鑒定 第二節(jié) 棉花纖維表達(dá)啟動(dòng)子的克隆和功能驗(yàn)證 一、纖維表達(dá)啟動(dòng)子的研究意義和進(jìn)展 二、棉花源纖維優(yōu)勢(shì)表達(dá)啟動(dòng)子 三、非棉花源種皮／纖維表達(dá)啟動(dòng)子 四、棉花纖維特異／優(yōu)勢(shì)表達(dá)啟動(dòng)子研究的問題和展望 第三節(jié) 轉(zhuǎn)基因技術(shù)體系的改良及應(yīng)用 一、轉(zhuǎn)基因技術(shù)體系的改艮 二、時(shí)空調(diào)控生長(zhǎng)素合成基因增加棉花纖維數(shù)量 三、轉(zhuǎn)基因優(yōu)質(zhì)纖維材料的創(chuàng)制 參考文獻(xiàn)第六章 優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)棉花新品種的分子改良 **節(jié) 棉花纖維品質(zhì)和產(chǎn)量性狀的遺傳分析方法 一、基于混合線性模型的復(fù)合區(qū)間作圖法 二、基于McIM的多變量QTL分析方法 三、基于MCIM的種子性狀QTL分析方法 四、基于MCIM的關(guān)聯(lián)分析方法 五、基于McIM的分析軟件開發(fā) 第二節(jié) 棉花纖維優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)分子改良的遺傳基礎(chǔ) 一、棉花纖維品質(zhì)和產(chǎn)量相關(guān)性狀的QTL定位 二、棉花種子品質(zhì)相關(guān)性狀的QTL定位 三、棉花纖維品質(zhì)分子標(biāo)記聚合選擇 第三節(jié) 棉花抗逆高產(chǎn)分子改良的遺傳基礎(chǔ) 一、棉花抗衰老功能基因篩選 二、棉花抗旱耐鹽性狀的遺傳分析與基因克隆 三、棉花抗黃萎病相關(guān)基因克隆與分析 第四節(jié) 優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)多抗棉花新品種的分子改良 一、陸海漸滲優(yōu)質(zhì)材料創(chuàng)制 二、棉花抗旱耐鹽新材料創(chuàng)制 三、棉花光敏雄性不育系材料創(chuàng)制 四、棉花抗早衰老材料創(chuàng)制 五、棉花優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)分子聚合新品種選育 參考文獻(xiàn)展望