第1章基因組學
　1.1基因組學的定義
　1.2基因組學的分類
　1.3基因組學研究現狀
　1.4研究功能基因組學的挑戰
　1.5我國基因組學研究進展
第2章生態與環境基因組學
　2.1生態與環境基因組學的含義
　2.2生態與環境基因組學的研究對象
　2.3生態與環境基因組學研究的主要項目
　2.4生態與環境基因組學研究的意義
第3章模式生物基因組學
　3.1模式生物的定義
　3.2模式生物基因組研究進展
　3.3模式生物的基因工程
第4章水體基因組學——海洋環境生態基因組學
　4.1水體的概念
　4.2水體污染治理方法與現狀
　4.3宏基因組學研究方法進展
第5章土壤基因組學
　5.1土壤宏基因組文庫
　5.2土壤宏基因組文庫的篩選技術
　5.3宏基因組測序及數據分析
　5.4基于宏基因組的微生物生態學與環境學分析
　5.5宏基因組學在土壤微生物生態學中的應用與展望
第6章環境中的病原微生物基因組學
　6.1通過基因組測序和功能注釋研究細菌致病機理
　6.2利用比較基因組學研究細菌致病性
第7章生態與環境基因組學研究方法
　7.1基因芯片
　7.2dna微陣列的原理與應用
　7.3熒光原位雜交技術
　7.4基因差異表達研究技術
第8章生態環境中的微生物群落功能基因與表達分析
　8.1環境微生物群落功能基因與定位
　8.2環境微生物群落功能基因表達分析
第9章生態環境中的抗逆、抗病基因
　9.1植物在生態環境中的抗逆機制
　9.2生態環境中的植物抗逆基因工程研究進展
　9.3植物抗逆相關基因的分離
　9.4植物在生態環境中的抗病研究
　9.5植物抗病基因工程的原理
第10章生態環境中的毒理基因組學
　10.1生態環境中毒理基因組學的產生
　10.2毒理基因組學的特點
　10.3生態與環境中的毒理基因組學技術支持
　10.4毒理基因組學的生物平臺
　10.5毒理基因組學的應用
　10.6毒理基因組學在生態風險評價方面的應用
　10.7毒理基因組學目前尚待解決的問題
　10.8microrna毒理基因組學的優勢和挑戰
　10.9結論與展望
第11章基因組學在生態環境中的催化和降解作用
　11.1生物降解
　11.2生物催化
　11.3生物催化和生物降解的信息學
　11.4總結
第12章基因組學在環境中對抗菌藥物的發現及影響
　12.1抗生素藥物篩選簡介
　12.2抗生素藥物發現的歷史進程
　12.3新藥物開發所遇到的挑戰
　12.4微生物基因組學和藥物靶點的篩選
　12.5確定治療用途：藥物靶點篩選和驗證
　12.6基因組學和毒理學：毒物基因組學的產生
　12.7總結
第13章基因組學與酶的發現和疫苗開發
　13.1酶的發現
　13.2疫苗的開發
第14章生態與環境基因組展望
　14.1基因組發展的領域
　14.2基因組學在生態環境中的實際應用
參考文獻